第二部分（取經因緣與取經人物）有許多不合歷史事實的地方。例如玄奘自請去取經，有詔不許；而《西遊記》說唐太宗征求取經的人，玄奘願往：這是一不合。又如玄奘本是緱氏人，父為士族；兄為名僧；他自身出家的事，本傳紀敘甚詳；而《西遊記》說他的父親是狀元，母親是宰相之女。但是狀元的兒子，宰相的外孫如何忽然做了和尚呢？因此有殷小姐忍辱報仇的故事造出來（參看《太平廣記》122陳義郎的故事），作為玄奘出家的理由。這是二不合。但這種變換，都是很在情理之中的。玄奘的家世與幼年事跡實在太平常了，沒有小說的興趣，故有改變的必要。況且玄奘既被後人看作神人，他的父母也該高升了，故升作了狀元與相府小姐。玄奘為經義難明，異說難定，故發憤要求得原文的經典：這種考據家的精神，是科學的精神，在我們眼里自然極可佩服；但這也沒有通俗小說的資格，故也有改變的必要。於是有魏徵斬龍與太宗遊地府的故事。這一大段是許多小故事雜湊起來的。研究起來，很有趣味。袁天罡的神算，自然是一個老故事（參看《太平廣記》七六，又二二一）。秦叔寶，尉遲敬德做門神，大概也是唐人的故事。涇河龍王犯罪的故事，已見於唐人小說。《太平廣記》四一八引《續玄怪錄》，敘李靖代龍王行雨，誤下了二十尺雨，致龍王母子都受天譴。這個故事是很古的。唐太宗遊地府的故事，也是很古的。唐人張鷟的《朝野僉載》有一則（王靜庵先生引《太平廣記》所引）云：

唐太宗極康豫。太史令李淳風見上，流淚無言。上問之，對曰，“陛下夕當晏駕。”……太宗至夜半，奄然入定，見一人云，“陛下踅合來，還即去也。”帝問君是何人，對曰，“臣是生人判冥事。”太宗入見判官，問六月四日事，即令還。向見者又迎送引導出。淳風即觀干象，不許哭泣。須臾乃寤。及曙，求昨所見者，令所司與一官，遂注蜀道一丞。

此事最有趣味，因為近年英因人斯坦因（Stein）在敦煌發見唐代的寫本書籍中，有一種白話小說的殘本，僅存中間一段云：

“判官懆惡，不敢道名字。”帝曰，“卿近前來。”輕道，“姓崔名子玉。”“朕當識。”言訖，使人引皇帝至院門，使人奏曰，“伏維陛下且立在此，容臣入報判官速來。”言訖，使者到廳前拜了，啟判官，“奉大王處 太宗是生魂到領，判官推勘，見在門外，未敢引。”判官聞言，驚忙起立。（下闕）（引見《東方雜志》十七卷，八號，王靜庵先生文中）

這個故事里已說到判官姓崔名子玉。我們疑心那魏徵斬龍及作介紹書與崔判官的故事也許在那損壞的部分里；可惜不傳了。崔判宮的故事到宋時已很風行，故宋仁宗嘉祐二年加崔府君封號詔有“惠存滏邑，恩結蒲人；生著令獻，沒司幽府”等語（引見《東方雜志》，卷頁同上）。這個故事可算很古了。

如果上文引的《納書楹曲譜》里的《西遊記》是吳昌齡的原本，那麽，殷小姐忍辱復仇，唐太宗征求取經人，等等故事由來已久，不是吳承恩新加入的了。

第三部分（八十一難）是《西遊記》本身。這一部分有四個來源。第一個來源自然是玄奘本傳里的記載，我們上文已引了最動人的幾段。那些困難，本是事實，夾著一點宗教的心理作用。他們最能給小說家許多暗示。沙漠上光線屈折所成的幻影漸漸的成了真妖怪了，沙漠的風沙漸漸的成了黃風大王的怪風和羅剎女的鐵扇風了，沙漠里四日五夜的枯燋漸漸的成了周圍八百里的火焰山了，烈日炎風的沙河漸漸的又成了八百里“鵝毛飄不起”的流沙河了，高昌國王漸漸的成了大唐皇帝了，高昌國的妃嬪也漸漸的成了托塔天王的假公主和天竺國的妖公主了。這種變化乃是一切大故事流傳時的自然命運，逃不了的，何況這個故事本是一個宗教的故事呢？

第二個來源是南宋或元初的《唐三藏取經詩話》和金、元戲劇里的《唐三藏西天取經》故事。這些故事的神話的性質，上文己說明了。依元代雜劇的體例看來，吳昌齡的《西遊記》雖為元代最長的六本戲，六本至多也不過二十四折；加上楔子，也不過三十折。這里面決不能紀敘八十一難的經過。故這個來源至多只能供給一小部分的材料。

第三個來源是最古的，是《華嚴經》的最後一大部分，名為《入法界品》的（晉譯第三十四品，唐譯第三十九品）。這一品占《華嚴經》全書的四分之一，說的只是一個善財童子信心求法，勇猛精進，經歷一百一十城，訪問一百一十個善知識，畢竟得成正果。這一部《入法界品》便是《西遊記》的影子，一百一十城的經過便是八十一難的影子。我們試看《入法界品》的布局：

（1）文殊師利告善財言，“善男子，於此南方，有一國土名曰可樂，其國有山名為和合；於彼山中，有一比丘名功德云。汝詣彼問，云何菩薩學菩薩行，修菩薩道，乃至云何具普賢行。”……

（2）功德云比丘告善財言，“善男子，南方有國名曰海門，彼有比丘名曰海云。汝應詣彼問菩薩行。”……

（3）海云比丘告善財言，“善男子，汝詣南方六十由旬，有一國土名曰海岸，彼有比丘名曰善住。應往問彼云何菩薩修清凈行。”……

（4）善住比丘言，“善男子，於此南方，有一國土名曰住林，彼有長者名曰解脫。汝詣彼問……”