谷中三崎町、動阪、駒迂千馱木町各有薩摩藩士三人被殺，三橋、築前藩士一人被殺，因州藩的彈藥輸送隊的輜重也被強奪。

這時，益次郎的居停在西本願寺附近的法衣屋。長州藩和西本願寺關係十分密切，益次郎是西本願寺介紹過來的房客。房東丹波除了這些對益次郎一無所知。

一開始丹波認為這是個鄉下暴發戶，到京都來收古董了。可是仔細一看大村還帶著刀，一付桀驁不馴的態度更讓別人不知道益次郎的本來面目。

益次郎整天早出晚歸，一回來就把自己關在房間裏不出來。

他雇了個女傭小琴照顧他生活，兩人之間多少有些交談。

益次郎有次問起女傭的名字。

“我叫小琴。”

益次郎看著小琴又說：“叫小琴的女人，京都有多少個啊？”這個問題讓人實在無法回答。

小琴說：“不知道。”

“如果知道和自己同名的人，那是件很開心的事。我這輩子一共認識兩個叫琴的女人。”

“另外一個是誰？”

“我的妻子。”益次郎冷冰冰的回答。此後就再也不交談了。

過了幾天，他又吩咐小琴：“你到河原町書店買些江戶的地圖，各種樣式的都要。”說著交給小琴一大筆錢。

小琴捧著地圖回來，大村就將地圖攤在自己的房間裏，用鉛筆圈圈點點。小琴好奇地問：“您要到江戶旅遊嗎？”

益次郎好像沒聽見一樣，過了老半天才回答：“是的。”

閏四月初，益次郎收拾地圖，從海路進京。新政府任命他去做軍務官判事，而不是參謀。發給他命令上寫著“江戶在勤”，看上去這只是職務調動，而不是戰備行動。

益次郎剛到任，就和西鄉請求將全體參謀集合起來。這位後來被稱為官軍的軍事制度創始人，當時的參謀們只認為他是個從京都來的閑官，愛理不理的。

益次郎的行動也“望之不似人君”，會議期間一言不發，會議結束也沒提什麼意見。

散會以後，益次郎揮手招過什器（器物）管理員在江戶城裏到處閑逛，最後來到位於西之丸的倉庫，他讓管理員開門下鎖，興致勃勃地鑒賞起了裏面的古董。

益次郎閑暇時就愛倒騰古董。據船越衛回憶：維新運動成功後，寂寞時候就去淘古董。不過這個超級計劃主義者有個怪癖，再好的東西，價格超過一兩以上的不買。他只買一兩之內的古董。他對自己的“一定之規”有這樣的解釋：“人總要找點娛樂，我的娛樂就是不超過一兩的古董，超過一兩，絕對不買。”

對這個喜歡“秦磚漢瓦”的人來說，西之丸的倉庫實在是個寶山，德川家幾世的珍寶都存於此地。

益次郎看得津津有味，突然躥進來一個人，大喊：“你幹什麼！？”這人是薩摩部隊的參謀海江田武次。海江田以為益次郎是來趁火打劫。

益次郎瞥了海江田一眼，過後就再也不搭理他了。這種態度讓海江田恨得咬牙切齒，直到晚年撰寫自傳《實歷史傳》時，還不忘記叫人寫上一筆：“我很偶然的在江戶城目擊了如下一幕，一間擺滿了書畫珍品、金銀珠玉的密室，滿目狼藉。這時密室裏只有一個人。”

其實看古董是益次郎剿滅彰義隊的第一步計劃：籌措軍費。諸藩的聯軍現在的囊中羞澀，他想用德川家收藏的一部分美術品，抵押給橫濱的外國人，充作軍費。

時任橫濱裁判所的判事（法官）寺島宗則（伯爵）的自傳記載如下：“時大村益次郎踞江戶城，募士屯集上野山內，思攻叛逆。旬日，遣使邀餘會。席間，大村云：欲攻然金不足，望招之橫濱外人，周旋錢餉。”

沒等大村向外國人“周旋錢餉”，“天上掉下餡餅來”，大村再也不需要賣古董了。

肥前佐賀藩士，京都新政府的外國事務局的判事大隗八太郎（重信，侯爵），押送著二十五萬兩從海路東下來到了東京。

新政府傾其所有，不是為了支援大村的討伐作戰，而是為了購買軍艦，幕府曾向美國訂購了一艘鐵甲艦，現在船開到了東京，新政府想買下這艘船。

美國大使不肯賣，他需要對日本的內戰保持一種中立的態度。

益次郎得知這個消息，就和薩摩藩辦交涉，決定用這筆錢剿滅彰義隊。

薩摩的參謀海江田不同意立即討伐。“官軍的兵力太少了，戰端一開，如果危及到總督府怎麼辦？”