這年四月六日，剛履行過“元服”儀式的少年天皇，在大阪城內馬場舉行閱兵式。其實這是對殘留在江戶的德川幕府、諸藩的變相示威。參加這次閱兵的還有薩摩、長州、藝州、築前、肥前等藩的部隊。

益次郎還是那副打扮，指揮部隊。官軍裏除了益次郎以外，沒人能夠策劃洋式閱兵。

不過益次郎還是出了點洋相。排列整齊的諸藩兵卒，正要迎接天皇上觀禮台。“禦親兵掛”的公卿萬裏小路道房，指著益次郎的鼻子責問：“汝！天子駕臨，禮數豈可廢！立拜？豈有此理！”

這個“棒槌”不知道舉槍敬禮這個西洋規矩。他認為這是“大不敬”。

益次郎拿著荷蘭、英國的軍事書籍，再三強調這是西洋軍隊最高的禮節。可又來了兩個“棒槌”幫腔。萬裏小路的朋友四條隆哥、鷲尾隆聚異口同聲說：“是啊！豈有此理！豈有此理！”

益次郎被弄得哭笑不得。據在一旁的船越衛說，火吹達磨短短一生中，臉上露出困惑的表情他只見過這一次。

這幫人還要爭論，只見錦旗飄揚，法螺聲響。十七歲的天子全副戎裝，走上了觀禮台。

台下的部隊只好把長槍放在地上，跪在地上向天皇致敬。

益次郎心想：“這種敬禮，看上去和投降一樣。”

這次閱兵前後，官軍從各個方向進軍日本東部。四月十一日，江戶城開門請降。

這期間大半的作戰計劃都是由大村制定的。

官軍雖說占領了江戶城，可還是四面受敵。江戶有彰義隊、大鳥圭介率領的殘兵敗將、槚本武揚的海軍。新政府和“騎墻派”奧羽諸藩之間也已開始了摩擦，後世稱為“戊辰戰爭”已經迫在眉睫了。

這片爛攤子裏最麻煩的就是彰義隊，他們挾兩千之眾蟠踞在江戶，他們和官軍的情勢可以說是一觸即發。

江戶城內總督府總參謀長西鄉吉之助的方針是：“（對彰義隊表現）最大限度的寬容。”

這是他和勝海舟、山岡鐵舟談判和平交接江戶城的條件之一，為了不負當初雙方的“君子協定”。所以現在他對彰義隊的暴行是“睜一眼、閉一眼。”他下令官軍對彰義隊任何挑釁，一律不還擊。

彰義隊卻不領情，兩軍之間的磨擦行動也逐漸升級了。

谷中三崎町、動阪、駒迂千馱木町各有薩摩藩士三人被殺，三橋、築前藩士一人被殺，因州藩的彈藥輸送隊的輜重也被強奪。

這時，益次郎的居停在西本願寺附近的法衣屋。長州藩和西本願寺關系十分密切，益次郎是西本願寺介紹過來的房客。房東丹波除了這些對益次郎一無所知。

一開始丹波認為這是個鄉下暴發戶，到京都來收古董了。可是仔細一看大村還帶著刀，一付桀驁不馴的態度更讓別人不知道益次郎的本來面目。

益次郎整天早出晚歸，一回來就把自己關在房間裏不出來。

他雇了個女傭小琴照顧他生活，兩人之間多少有些交談。

益次郎有次問起女傭的名字。

“我叫小琴。”

益次郎看著小琴又說：“叫小琴的女人，京都有多少個啊？”這個問題讓人實在無法回答。

小琴說：“不知道。”

“如果知道和自己同名的人，那是件很開心的事。我這輩子一共認識兩個叫琴的女人。”

“另外一個是誰？”

“我的妻子。”益次郎冷冰冰的回答。此後就再也不交談了。

過了幾天，他又吩咐小琴：“你到河原町書店買些江戶的地圖，各種樣式的都要。”說著交給小琴一大筆錢。

小琴捧著地圖回來，大村就將地圖攤在自己的房間裏，用鉛筆圈圈點點。小琴好奇地問：“您要到江戶旅遊嗎？”

益次郎好像沒聽見一樣，過了老半天才回答：“是的。”

閏四月初，益次郎收拾地圖，從海路進京。新政府任命他去做軍務官判事，而不是參謀。發給他命令上寫著「江戶在勤”，看上去這只是職務調動，而不是戰備行動。

益次郎剛到任，就和西鄉請求將全體參謀集合起來。這位後來被稱為官軍的軍事制度創始人，當時的參謀們只認為他是個從京都來的閑官，愛理不理的。

益次郎的行動也“望之不似人君”，會議期間一言不發，會議結束也沒提什麼意見。

散會以後，益次郎揮手招過什器（器物）管理員在江戶城裏到處閑逛，最後來到位於西之丸的倉庫，他讓管理員開門下鎖，興致勃勃地鑒賞起了裏面的古董。

益次郎閑暇時就愛倒騰古董。據船越衛回憶：維新運動成功後，寂寞時候就去淘古董。不過這個超級計劃主義者有個怪癖，再好的東西，價格超過一兩以上的不買。他只買一兩之內的古董。他對自己的“一定之規”有這樣的解釋：“人總要找點娛樂，我的娛樂就是不超過一兩的古董，超過一兩，絕對不買。”

對這個喜歡“秦磚漢瓦”的人來說，西之丸的倉庫實在是個寶山，德川家幾世的珍寶都存於此地。

益次郎看得津津有味，突然躥進來一個人，大喊：“你幹什麼！？”這人是薩摩部隊的參謀海江田武次。海江田以為益次郎是來趁火打劫。

益次郎瞥了海江田一眼，過後就再也不搭理他了。這種態度讓海江田恨得咬牙切齒，直到晚年撰寫自傳《實歷史傳》時，還不忘記叫人寫上一筆：“我很偶然的在江戶城目擊了如下一幕，一間擺滿了書畫珍品、金銀珠玉的密室，滿目狼藉。這時密室裏只有一個人。”