艾塞克斯比培根小五歲。他1581年從劍橋大學畢業，1584年入宮為臣，1585年隨軍遠征芬蘭並立下功勛。艾塞克斯年輕英俊，年齡差不多大他三倍的女王曾經青睞於他，因此他成為宮廷里的寵臣。

由於哥哥安東尼的關係，培根與艾塞克斯得以經常接觸。培根經常給艾塞克斯提出一些有益的建議或忠告，艾塞克斯也很同情培根仕途上的坎坷。艾塞克斯曾三次在女王面前為培根謀求要職，但是每一次都落空了。艾塞克斯過於自信，他以為憑著自己在宮廷和女王心目中的位置，足以使他可以提名培根為委任官員。但事實上卻遠非如此，女王雖然寵幸艾塞克斯，但她歷來都小心地避免人們在政治上利用自己的感情。

艾塞克斯為培根求官不成，感到有一些對不住培根。1595年，他把自己一處價值1800英鎊的莊園贈與培根。艾塞克斯在給培根的信中說：你倒霉地選擇了我作為你的依靠，在我的事情上，你已經花費了許多時間和精力，希望你不會拒絕我的禮物。

培根在覆信中並沒有講到感謝艾塞克斯的話（他是打算讓女王看到該信），他說他接受伯爵贈與的禮物，不是為了個人，而是為了更好地為女王服務，為了更好地從事哲學事業，為了公共的善。培根在信中暗示說他並不是依附於某個個人的。艾塞克斯的初衷是要拉攏一批政治支持者，培根卻宣布自己是完全獨立的。這樣，兩人之間的關係就逐漸疏遠了。

第二年，當監護法院首席法官的職位空缺時，培根提出了候選申請。這一次，艾塞克斯就已經不那麼熱心了。1597年，培根出版其第一本著作《論說文集》，他沒有把書題獻給艾塞克斯，而是獻給了自己的哥哥安東尼。

不過，艾塞克斯仍然需要培根，因為培根畢竟有著豐富的閱歷，可以給他提供不少有益的建議。此時的艾塞克斯與女王的關係已經開始走下坡路。1596年，艾塞克斯摧毀西班牙無敵艦隊殘部，一下子成了民族英雄，於是開始高傲自大起來。培根因此而感到擔心，他警告艾塞克斯要注意自身修養，要在智慧上能與女王相匹配。

1598年，艾塞克斯率軍遠征愛爾蘭，鎮壓泰龍伯爵所領導的愛爾蘭起義。出征前，培根曾建議他不要親自帶兵，因為泰龍機智善戰、不易征服。而女王則志在滅敵，所以肯定是一個出力不討好的任務。果然，兩個月的戰役過去後，他所率領的三萬軍隊只剩下了四千。9月，他會見泰龍，同意了相當於英國無條件投降的條款。伊麗莎白女王非常震怒，明令他不得離開愛爾蘭。艾塞克斯無視命令，擅自離開愛爾蘭返回英國。女王下令逮捕了艾塞克斯，直到第二年6月才釋放。

培根對待艾塞克斯的態度有些矛盾。從感謝艾塞克斯和私人友誼考慮，在有人控告艾塞克斯時，培根曾經以不同的筆調偽造通信，以證明艾塞克斯非常忠誠於女王，並證明有人在散布謠言、嫁禍於艾塞克斯。他又寫信規勸艾塞克斯，希望他“不要飛得離太陽太近”，以免蠟翼融化、墜海而死。另一方面，他也明確表示自己首先還是要忠誠於女王。