（三）馬來屬邦(The Non-Federated Malay States)

馬來半島北部的幾個州，如玻璃市、吉打、吉蘭丹和丁加奴這時還在暹羅的“保護”之一。1909年，英國又和暹羅達成協議（曼谷協議：the Bangkok Treaty），獲得了該項“保護權”，並且根據協議還有權向這幾個州派駐顧問官，但卻遭到了玻璃市和吉打等州的拒絕。實際上，英國與暹羅早在1826年就曾達成過秘密協議，即伯尼協議( the Burney Treaty)，承認他們各自在馬來半島南、北地區的勢力範圍。1909年協議不僅使英國在這一地區的勢力範圍延伸到了半島北部，還在於今天馬來西亞與泰國的邊境得到了確立。1919年，英國把包括南部的柔佛（於1914年接受了英國顧問官）在內的5個蘇丹國在行政上進一步統一起來，這就是所謂的5個馬來屬邦。

1941年2月15日至1945年8月15日，為日本占領今馬來半島時期。這期間，半島的經濟社會發展出現了全面停滯，甚至倒退，尤其是廣大華人遭受到了前所未有的生命和財產損失，迫使他們拿起武器，成立馬來亞人民抗日軍，在馬來亞共産黨的率領下，開展了長期的抗戰鬥爭。日本人的占領政策還在馬來人和華人之間，制造了影響深遠的族群矛盾。 

二戰後，英國人卷土重來，決定在馬來半島實行一種新的統治，以加速其政治一體化。1945年10月10日，英議會提交了一份白皮書，提議將包括滿剌加和檳榔嶼（新加坡除外，仍為英國直屬殖民地）在內的馬來亞所有各州聯合為一個實體，即馬來亞聯邦(The Malaya Union)。1946年1月，馬來亞聯邦協議獲得通過，4月1日，聯邦正式宣佈成立。由於英國的這一做法威脅到了各州統治者的利益，而在給華人國籍方面也與馬來人有很大分歧，所以，遭到了馬來人的全面抵制，以致不得不於當年7月宣佈將這一決定撤銷。然而，這一政治經歷卻加速了馬來民族主義與華人民族主義的發展，加速了馬來亞政黨政治加族群政治的進程，尤其奠定了影響至今的基本的政黨結構，這就是三大族群政黨的建立：代表馬來族群的馬來人國家統一組織（巫統：UMNO，成立於1946年5月）、代表華裔族群的馬來亞華人公會（馬華/MCA，成立於1949年）以及代表印裔族群的馬來亞印度國民大會（MIC，成立於1946年）。

不過，另一方面，隨後而來的獨立鬥爭，卻也奠定了馬來亞及後來馬來西亞的族群合作的基礎和傳統。1957年8月31日，馬來亞正式宣佈從英國殖民統治下獲得獨立（仍作為英聯邦成員之一），就是包括三大族群在內的馬來亞各族人民共同奮鬥的結果，而以華人為主的抗英鬥爭所作的貢獻是不能磨滅的。 

二戰期間，馬來亞華人在馬來亞共産黨的率領下，本來曾與英國人一道反抗過日本侵略者，並為此做出了巨大的犧牲和貢獻。但是，戰後英國人主導的馬來亞政治進程，卻未能保障華人的基本權益，尤其把馬來亞共産黨排除在進程之外，結果迫使其繼續拿起武器，進入熱帶叢林，開展抗英遊擊戰爭。英國殖民當局則宣佈了全面的緊急狀態（1948年6月16日宣佈霹靂、柔佛為戒嚴區，17日宣佈全部馬來亞進入緊急狀態，直到1960年7月31日始恢復正常狀態），同時還執行了改變半島居民居住結構的布里格斯計劃（The Briggs Plan），即在半島西部建立了大批的華人新村，以隔斷華人與遊擊隊之間的聯系。